Taxonomia își are originea într-un cuvânt grecesc care înseamnă "hirotonire" . Aceasta este știința clasificării aplicată în biologie pentru organizarea sistematică și ierarhică a grupurilor de animale și plante .

În mod specific, putem stabili că taxonomia este împărțită în două: microtaxonomia, care este responsabilă pentru delimitarea și descrierea anumitor specii; și macrotaxonomia, care este cea care se clasifică pe baza criteriilor acordate de ramura anterioară.

De asemenea, este important să se stabilească faptul că taxonomia este în mare măsură legată de ceea ce se numește sistematică. Aceasta poate fi definită drept știința care este responsabilă pentru efectuarea studiului relațiilor de rudenie, numite și afinități care apar între diferite specii.

Toate acestea fără a trece peste legătura strânsă care există între taxonomie și alte științe sau probleme cum ar fi evoluția, paleontologia, genetica, biologia moleculară, filogenie sau embriologie.

Taxonomia biologică face parte din biologia sistematică, dedicată analizei relațiilor de rudenie dintre organisme. Odată ce arborele filogenetic al organismului în cauză este rezolvat și ramurile sale evolutive sunt cunoscute, taxonomia este responsabilă de studierea relațiilor de rudenie.

Pe lângă toate acestea, trebuie subliniat faptul că, atunci când lucrăm cu taxonomia, dezvoltăm și punem în practică, este vital să avem clarificări diferitele concepte care sunt fundamentale în ea. Acesta ar fi cazul următoarelor:

Caracter, care se referă, de exemplu, la caracteristicile plantei.

Starea caracterului, adică valorile pe care personajul le poate dobândi.

Caracterele de diagnosticare sunt cele care sunt utilizate în mod clar pentru a continua discriminarea taxonomică.

Caracterele derivate. Acestea sunt identificate ca fiind de tip dinamic și pentru că pot furniza informații despre apariția unor noi linii. Toate acestea pot fi făcute de aceia care sunt stările care pot avea un caracter diferit față de strămoșul lor, deoarece sunt modificate.

Există diferite poziții în ceea ce privește taxonomia, deși, în general, se susține că funcția sa începe atunci când filogenia taxonomică este deja definită. Acesta este motivul pentru care taxonomia organizează arborele filogenetic în cadrul unui sistem de clasificare.

Cea mai largă viziune înțelege taxele ca și clade (ramuri ale arborelui filogenetic, cu specii legate de un strămoș comun) care au fost deja atribuite unei categorii taxonomice.

Procesul de taxonomie continuă cu atribuirea numelor (conform principiilor nomenclatorului), elaborarea cheilor de identificare dihotomice și crearea sistemelor de clasificare.

Taxele permit clasificarea ființelor vii dintr-o ierarhie a incluziunii (fiecare grupă include și alți minori, în timp ce este subordonată unei persoane mai mari). Categoriile fundamentale, de la cel mai cuprinzător la cel mai mic, sunt domeniul, împărăția, marginea sau diviziunea, clasa, ordinea, familia, genul și specia .

Trebuie remarcat faptul că progresele înregistrate în cunoașterea ADN și problemele legate de biodiversitate reprezintă mari provocări pentru taxonomie.